Guide: Folding@Home

[haalo]

Flott .

[O.J]

*i mine innlegg*

[Tordenflesk]

Har dette prosjektet ført til noen konkrete, praktisk nyttige resultater?

Hvis ja, så joiner jeg.

http://folding.stanford.edu/English/Papers

[lockdog]

Da starta jeg opp F@H på en dobbeltkjerne + en PS3

[Thor.]

Burde kanskje nevnes at ATis nyere kort (R500 og oppover) kan bli brukt til folding med svært gode resultater.

Hva med GeForce 8 serien? har et 8800gts 512 kort på "tomgang"

[klilleng]

Har dette prosjektet ført til noen konkrete, praktisk nyttige resultater?

Hvis ja, så joiner jeg.

http://folding.stanford.edu/English/Papers

Joda, har sett der. Men er det noen av resultatene som har blitt benyttet i en faktisk utvikling av noe? En medisin? Behandling? Eller er det kanskje litt tidlig for slikt?

[Theo343]

Har dette prosjektet ført til noen konkrete, praktisk nyttige resultater?

Hvis ja, så joiner jeg.

http://folding.stanford.edu/English/Papers

Joda, har sett der. Men er det noen av resultatene som har blitt benyttet i en faktisk utvikling av noe? En medisin? Behandling? Eller er det kanskje litt tidlig for slikt?

Det blir benyttet til faktisk medisinsk forskning og forståelse av hvordan sykdommene utvikler seg.

 

Burde kanskje nevnes at ATis nyere kort (R500 og oppover) kan bli brukt til folding med svært gode resultater.

Hva med GeForce 8 serien? har et 8800gts 512 kort på "tomgang"

Forløpig er det kun ATI kort, men de har lovet G80 støtte etterhvert og da kommer sikkert også G92.

 

Hyggelig at det fortsatt er liv i leiren!

Synd at brannmur systemet på jobben har satt kjepper i hjulene så jeg mistet muligheten til å Folde på jobb maskinen også. Så da er det 2 maskiner hjemme + noen venners PC-er som folder under mitt Zimon nick for hw.no sitt lag.

Sett opp VPN

 

Er nok ikke så enkelt med tanke på at firmaet kjører 2003 servere i domene hvor også all trafikken går igjennom HQ i Nederland. Firmaet jeg jobber i er blant de 500 største selskapene i verden og har over 75000 ansatte. Så det er nok lite "lille" meg som driver med Teknisk Support klarer å påvirke IT geekene i Nederland.

 

Kan hende at de har løsnet "grepet" nå med tanke på at jeg vet at de har justert og byttet ut noe av software og hardware. Så kanskje prøve å installere en eller annen dag. Heldigvis har jeg lokal admin rettigheter på min lokale maskin.

Forsøk å sette opp en SSH tunell, det er ofte enklere å portmanipulere enn VPN.

[a-z]

"Per i dag er det over 200 000 aktive prosessorer på verdensbasis. Til sammen utgjør dette en vanvittig regnekraft."

 

Hvorfor?

<{POST_SNAPBACK}>

Hva mener du?

 

En moderne prosessor har en kapasitet på flere milliarder regneoparasjoner per sekund. Ganger man det med 200.000 så blir det en ganske vanvittig regnekraft.

<{POST_SNAPBACK}>

poenge med å ha denne regnekraften lurte eg på

 

Fordi to hoder tenker bedre enn ett?

[MrLee]

Du er klar over at du svarer på ett spørsmål fra 2006?

[daffyd]

Forsøk å sette opp en SSH tunell, det er ofte enklere å portmanipulere enn VPN.

 

Jeg pleide å lage ssh-tuneller stadig vekk, helt til noen på sikkerhet minte meg på at de ble litt skeptisk når de ser en maskin innenfor brannmuren sin som oppretter en kryptert tunell mot en ukjent maskin på utsiden... Typisk trojaner-virksomhet, og noe sikkerhet bør slå hardt ned på. Det man derimot kan gjøre er å be sikkerhet pent om man kan få lov til å opprette ssh tuneller til bestemte maskiner. De fleste (jeg har vært i kontakt med) pleier å være greie når de får slike konkrete (og velfunderte) forespørsler. Det er i det minste verdt et forsøk (Og jeg anbefaler alle å ikke forsøke å kjøre ssh-tuneller over http/ssl (80/443), det er bare med på å gjøre en ultranervøs sikkerhetsavdeling enda mer nervøse...)

[vgard]

Dumt spørsmål kanskje, men la gå..

Jeg klarer ikke å finne meg selv på stats sidene hverken hos Stanford eller Extreme overclocking. Hvor lang tid vil det ta før jeg vises der? Startet folding i går natt og Electron Microscope tilsier at jeg har 4135,8 poeng. Begynte på to nye WU i dag morges ca 10:55.

 

*EDIT*

Nevermind, var nok bare litt for kjapp, sjekka igjen nå og fant meg.

Endret 30. april 2008 av vgard

[a-z]

Du er klar over at du svarer på ett spørsmål fra 2006?

 

Åja, det så jeg ikke men jaja, bedre sent enn aldri :!:

[uggabugga]

Har satt igang folding på en 64 bits Ubuntu (specs i signatur). Brukte instruksjonene jeg fant HER etter å ha fulgt en link her på forumet. Ser ut som det funker perfekt, og merker fint lite til at det går i bakgrunnen. Greier 2-3 WU's a'1760 poeng i døgnet (ca 18 timer/WU). Er litt nysgjerrig, og kunne tenkt meg litt forklaring på hva det som kommer når den er ferdig med en unit betyr? Noen som føler seg kallet? Copy-paste fra klienten i spoilerbox'en.

 

 

[08:57:57] Completed 490000 out of 500000 steps (98 percent)

[09:08:23] Writing local files

[09:08:23] Completed 495000 out of 500000 steps (99 percent)

[09:18:51] Writing local files

 

 

 

M E G A - F L O P S A C C O U N T I N G

 

Parallel run - timing based on wallclock.

RF=Reaction-Field FE=Free Energy SCFE=Soft-Core/Free Energy

T=Tabulated W3=SPC/TIP3p W4=TIP4p (single or pairs)

NF=No Forces

 

Computing: M-Number M-Flops % of Flops

-----------------------------------------------------------------------

VdW(T) 1360949.666030 73491281.965620 16.6

RF Coul 544016.456566 17952543.066678 4.0

RF Coul [W3] 2441.295019 239246.911862 0.1

RF Coul + VdW(T) 616767.249704 40089871.230760 9.0

RF Coul + VdW(T) [W3] 284629.981762 37001897.629060 8.3

RF Coul + VdW(T) [W3-W3] 768855.880328 246033881.704960 55.5

Outer nonbonded loop 236908.591632 2369085.916320 0.5

1,4 nonbonded interactions 1099.502199 98955.197910 0.0

NS-Pairs 500570.477836 10511980.034556 2.4

Reset In Box 3877.427547 34896.847923 0.0

Shift-X 77451.154902 464706.929412 0.1

CG-CoM 1765.735314 51206.324106 0.0

Sum Forces 116320.732641 116320.732641 0.0

Bonds 13261.526523 570245.640489 0.1

Angles 15618.531237 2545820.591631 0.6

Propers 5376.010752 1231106.462208 0.3

Impropers 1006.002012 209248.418496 0.0

RB-Dihedrals 14156.028312 3496538.993064 0.8

Virial 38827.577655 698896.397790 0.2

Update 38773.577547 1201980.903957 0.3

Stop-CM 38773.500000 387735.000000 0.1

P-Coupling 38773.577547 232641.465282 0.1

Calc-Ekin 38773.655094 1046888.687538 0.2

Constraint-V 38773.577547 232641.465282 0.1

Constraint-Vir 25213.550427 605125.210248 0.1

Settle 8404.516809 2714658.929307 0.6

-----------------------------------------------------------------------

Total 443629402.657100 100.0

-----------------------------------------------------------------------

 

NODE (s) Real (s) (%)

Time: 62864.000 62864.000 100.0

17h27:44

(Mnbf/s) (GFlops) (ns/day) (hour/ns)

Performance: 56.911 7.057 1.374 17.462

[09:18:51] Completed 500000 out of 500000 steps (100 percent)

[09:18:51] Writing final coordinates.

[09:18:51] Past main M.D. loop

[09:18:51] Will end MPI now

[09:19:51]

[09:19:51] Finished Work Unit:

[09:19:51] - Reading up to 3722496 from "work/wudata_07.arc": Read 3722496

[09:19:51] - Reading up to 1774784 from "work/wudata_07.xtc": Read 1774784

[09:19:51] goefile size: 0

[09:19:51] logfile size: 16913

[09:19:51] Leaving Run

[09:19:56] - Writing 5518593 bytes of core data to disk...

[09:19:56] ... Done.

[09:19:56] - Shutting down core

[09:19:56]

[09:19:56] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT

[0]0:Return code = 100

[0]1:Return code = 0, signaled with Quit

[0]2:Return code = 0, signaled with Quit

[0]3:Return code = 0, signaled with Quit

[09:20:01] CoreStatus = 64 (100)

[09:20:01] Unit 7 finished with 82 percent of time to deadline remaining.

[09:20:01] Updated performance fraction: 0.809990

[09:20:01] Sending work to server

 

 

[09:20:01] + Attempting to send results

[09:20:01] - Reading file work/wuresults_07.dat from core

[09:20:01] (Read 5518593 bytes from disk)

[09:20:01] Connecting to http://171.64.65.64:8080/

[09:21:28] Posted data.

[09:21:28] Initial: 0000; - Uploaded at ~61 kB/s

[09:21:28] - Averaged speed for that direction ~61 kB/s

[09:21:28] + Results successfully sent

[09:21:28] Thank you for your contribution to Folding@Home.

[09:21:28] + Number of Units Completed: 6

 

[0]0:Return code = 18

[0]1:Return code = 0, signaled with Quit

[0]2:Return code = 0, signaled with Quit

[0]3:Return code = 0, signaled with Quit

[09:25:32] - Warning: Could not delete all work unit files (7): Core returned invalid code

[09:25:32] Trying to send all finished work units

[09:25:32] + No unsent completed units remaining.

[09:25:32] - Preparing to get new work unit...

[09:25:32] + Attempting to get work packet

[09:25:32] - Connecting to assignment server

[09:25:32] Connecting to http://assign.stanford.edu:8080/

[09:25:33] Posted data.

[09:25:33] Initial: 40AB; - Successful: assigned to (171.64.65.56).

[09:25:33] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home

[09:25:33] Loaded queue successfully.

[09:25:33] Connecting to http://171.64.65.56:8080/

[09:25:36] Posted data.

[09:25:36] Initial: 0000; - Receiving payload (expected size: 2428430)

[09:25:40] - Downloaded at ~592 kB/s

[09:25:40] - Averaged speed for that direction ~646 kB/s

[09:25:40] + Received work.

[09:25:40] Trying to send all finished work units

[09:25:40] + No unsent completed units remaining.

[09:25:40] + Closed connections

[09:25:40]

[09:25:40] + Processing work unit

[09:25:40] Core required: FahCore_a1.exe

[09:25:40] Core found.

[09:25:40] Working on Unit 08 [May 2 09:25:40]

[09:25:40] + Working ...

[09:25:40] - Calling './mpiexec -np 4 -host 127.0.0.1 ./FahCore_a1.exe -dir work/ -suffix 08 -checkpoint 15 -forceasm -verbose -lifeline 6501 -version 601'

 

[09:25:40]

[09:25:40] *------------------------------*

[09:25:40] Folding@Home Gromacs SMP Core

[09:25:40] Version 1.74 (November 27, 2006)

[09:25:40]

[09:25:40] Preparing to commence simulation

[09:25:40] - Ensuring status. Please wait.

[09:25:57] - Assembly optimizations manually forced on.

[09:25:57] - Not checking prior termination.

[09:25:57] - Expanded 2427918 -> 12874977 (decompressed 530.2 percent)

[09:25:57] - Starting from initial work packet

[09:25:57]

[09:25:57] Project: 2605 (Run 16, Clone 463, Gen 46)

[09:25:57]

[09:25:57] Assembly optimizations on if available.

[09:25:57] Entering M.D.

NNODES=4, MYRANK=3, HOSTNAME=ubuntubolla

NNODES=4, MYRANK=1, HOSTNAME=ubuntubolla

NNODES=4, MYRANK=2, HOSTNAME=ubuntubolla

NNODES=4, MYRANK=0, HOSTNAME=ubuntubolla

NODEID=1 argc=15

NODEID=2 argc=15

NODEID=3 argc=15

NODEID=0 argc=15

Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.

Copyright © 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.

Copyright © 2001-2004, The GROMACS development team,

check out http://www.gromacs.org for more information.

 

This inclusion of Gromacs code in the Folding@Home Core is under

a special license (see http://folding.stanford.edu/gromacs.html)

specially granted to Stanford by the copyright holders. If you

are interested in using Gromacs, visit www.gromacs.org where

you can download a free version of Gromacs under

the terms of the GNU General Public License (GPL) as published

by the Free Software Foundation; either version 2 of the License,

or (at your option) any later version.

 

[09:26:04] Rejecting checkpoint

starting mdrun 'Protein in POPC'

500000 steps, 1000.0 ps.

 

[09:26:04] Protein: Protein in POPCExtra SSE boost OK.

[09:26:04]

[09:26:04] Extra SSE boost OK.

[09:26:05] Writing local files

[09:26:05] Completed 0 out of 500000 steps (0 percent)

 

 

[uggabugga]

Jippi!

 

Vi passerte nettopp Futuremark.com teamet, og er oppe på 43. plass!

 

[Dauemannen]

Jippi!

 

Vi passerte nettopp Futuremark.com teamet, og er oppe på 43. plass!

 

Nettopp? Vi er da nesten 400 000 poeng foran.

[Toast Is Pimp!]

Gutter. Jeg Holder på med BOINC. Aner ikke hvilken pioritet det kjører på. Men jeg oppdager faktisk ikke at BOINC/SETI tar 100% av CPU'en.

Jeg kjører programmet hele tiden, ikke bare når jeg ikke er på PC-en.

Har AM2 3500+ fra eldre 2006.

 

Ingen problemer og folde/søke_etter_liv mens jeg er på PC-en. Annbefaler dere og la den gå hele tiden, for de som ikke sliter med varme.

 

Noen som har URL'en til Prosjektet? Min BOINC klient vil ikke finne den.

Endret 7. mai 2008 av Deimos87

[vgard]

Huhei som det går..

Folder for harde livet, begynte 30.04 og nå har jeg ca 7000 poeng. Stasjonære har stort sett folda non stop. Har folda en WU på laptop, men den ble så varm at jeg tror jeg stopper det prosjektet. Dessuten er den ikke på så ofte at det gjør noe. Ser Mr Kane prøver å ta meg igjen, men får det ikke helt til. tatt innpå 6 poeng siden siste update, men ved neste kommer jeg til å ta litt i fra igjen når jeg klokker inn ca 1200 poeng. hehe. Morsomt å følge litt med på hva som skjer og hvordan jeg ligger an. 713. plass and rising. Sjekker både Stanford og extremeoverclocking(min profil)(venter fremdeles på update på score på extremeoverclocking.)

[Redak Tøren]

Ikke for å pirke, men siden Hardware-Nettverket har kommet med en ny navnepolitikk, må jeg påpeke at Folding@Home ikke er i tråd med det.

 

Folding@Home er et sammensatt av to ord (egentlig tre da @ betyr "at"). Den nye politikken tillater ikke kapitalisering av bokstaver annet enn forbokstav og eventuell forbokstav hvis navnet er flere ord.

 

Det riktig i følge deres politikk skal være Folding@home

 

Etter som dere ønsker å gi minst mulig publisitet og reklame for et produkt, når dere allikevel velger å skrive om produkter nettopp for å opplyse, burde dere kanskje skrevet Foldingathome slik at færrest mulig lesere finner produktnavnet/merkenavnet/logoen/snikreklamen forstyrrende.

Endret 8. mai 2008 av atomtissetasen

[Toast Is Pimp!]

apple Apple windows Windows vista Vista ipod Ipod pod, større sjangs at vi får hits på google..

 

Men til saken:

 

Hva er Folding@home sin adresse når jeg skal legge den til klienten BOINC? Orker ikke noe tekstbasert opplegg. Mye finere med grafisk, mulighet for og "se" hva som skjer er morro, feks SETI...

[vgard]

Fant en stilig gadget til Vista Sidebar som viser score og diverse info(for bruker og team).. Hvis noen har lyst på den kan de trykke her(link til plugin på windows live gallery).