[Løst] ".fa" Trenger et program for å lese filer av typen "FASTA"

[Dufen]

Fruen leser biokjemi og holder på å lære seg med et program for DNAsekvensering.

Hun får ut en graf ut av programmet Chromas som igjen lagres som en fil med endingen .fa

Men vi finner ingen lesere som kan gjøre denne grafen om til lesbart materiale i form av en bokstavrekke.

 

De leserne vi finner koster 500 dollar eller mer, og dette er bare til en enkelt skoleoppgave.

 

Løsninger?

[Gjest medlem-82119]

Har ikke vært borti den filtypen før, men ser det er endel java løsninger som ser ut til å være gratis:

 

Søkte på fasta reader:

 

Biojava ser ut til å være populært: http://biojava.org/wiki/Main_Page

 

Ellers er det masse annet, som denne:

 

http://jfasta.sourceforge.net/example1.html

[OJodd]

FASTA-filer (.fa) er et tekst-basert filformat. Sekvensene som filene inneholder er dermed i klartekst. Åpne filene i notisblokk, eller et lignende tekstprogram (ikke Word).

 

Formatet for filene er nærmere beskrevet her:

http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format

 

For enklere åpning av filene fra Chroma kan de også lagres direkte som .txt istedenfor .fa. Lykke til!

[Dufen]

Siste forslag fungerte

 

Tusen takk for hjelpen