Har kommet frem til en løsning, om noen skulle finne denne tråden senere
Etter en del videre testing og 3 grillede Arduino Nano'er kom vi fram til at det var solenoidene og/eller motoren i pumpa som grillet Arduinoene og fikk spenningsregulatoren til å bli glovarm. Som regel fungerte det å kjøre prosessen én gang helt til pumpen og solenoidene ble slått av. Løsningen var dioder på solenoid spolene og to zener dioder på 18V på pumpen (siden den må kunne gå begge veier).
Bruker også kondensatorene som det står i databladet
Om noen skulle finne denne tråden i fremtiden, tror jeg jeg har funnet den beste løsningen her: http://www.pamvotis.org/e-solutions/index.php/en/2013-01-05-14-08-40/arduino-acpwm-library
Har ikke testet denne ennå.